涉500多个基因,首个泛癌种伴随诊断体外诊断试剂盒在美获批
当地时间2024年8月27日,基因测序知名企业——美国因美纳(Illumina,ILMN.US)公司公告称,其体外诊断产品(IVD)——TruSight Oncology(以下简称“TSO”)Comprehensive检测试剂盒及其两种伴随诊断适应证已获FDA(美国食品药品监督管理局)批准。Illumina称,这是第一个获得FDA批准的可用于泛癌伴随诊断的基因组体外诊断试剂盒。
基于DNA的NGS方法可以检测多种变异类型,但缺点是当检测到基因易位时,很难确定这些是否是导致功能性表达的融合。此外,融合发生位点具有不确定性,对于一些内含子序列较长的基因,比如NTRK2和NTRK3,对罕见融合检出经验和探针设计要求高。通过DNA全面覆盖各类融合突变比较困难。 而基于RNA的NGS方法虽然具有高准确性、特异性和灵敏度。但是,该方法对检测样本(也就是RNA)质量的要求很高。因此,基于各方法的优缺点,对于条件允许的医院和患者初步诊断时建议选择NGS检测NTRK融合,并且优先推荐DNA+RNA的NGS检测,才能够更加全面地检测NTRK融合,最大限度的避免了漏检和错检。
在已知具有高频率NTRK融合的特定类型肿瘤中利用FISH、RT-PCR或RNA-NGS方法直接确诊;而在NTRK基因融合发生率较低的肿瘤类型中,若条件允许可使用NGS的方法直接确诊,否则可先使用IHC的方法初筛而后使用NGS(建议包含RNA)确诊。