NTRK精准检测

发现成人和儿童患者的
NTRK融合突变
NTRK检测及诊断
临床上可以间接或直接用于检测临床组织样本中NTRK基因融合的方法
IHC
免疫组织化学
FISH
荧光原位杂交
RT-PCR
逆转录酶聚合酶链反应
NGS
基于DNA和/或RNA的
下一代测序
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为什么DNA+RNA的NGS是用于检测NTRK融合的最佳方法?

基于DNA的NGS方法可以检测多种变异类型,但缺点是当检测到基因易位时,很难确定这些是否是导致功能性表达的融合。此外,融合发生位点具有不确定性,对于一些内含子序列较长的基因,比如NTRK2和NTRK3,对罕见融合检出经验和探针设计要求高。通过DNA全面覆盖各类融合突变比较困难。 而基于RNA的NGS方法虽然具有高准确性、特异性和灵敏度。但是,该方法对检测样本(也就是RNA)质量的要求很高。因此,基于各方法的优缺点,对于条件允许的医院和患者初步诊断时建议选择NGS检测NTRK融合,并且优先推荐DNA+RNA的NGS检测,才能够更加全面地检测NTRK融合,最大限度的避免了漏检和错检。

ESMO推荐的
NTRK基因融合检测策略

在已知具有高频率NTRK融合的特定类型肿瘤中利用FISH、RT-PCR或RNA-NGS方法直接确诊;而在NTRK基因融合发生率较低的肿瘤类型中,若条件允许可使用NGS的方法直接确诊,否则可先使用IHC的方法初筛而后使用NGS(建议包含RNA)确诊。